- 一些与拓扑扭结检索相关的项目汇集于此。我们旨在实现对小于等于 11-crossing 的扭结的区分。
- 由于 repo 有有很多的 submodule，所以 clone 时要注意使用
--recursive参数。 - 关于 PD Code 的定义请参考：
- 非素链环表示
- 小于等于 10 crossing 素扭结列表以及其组合
- K 分图的边组合生成问题
- 给出链环 pd code 计算所有连通分支
- 给一个 list of list，检验他是否是合法的 pd_code （弱合法性）
- 给定 pd_code 求一个对应的平面布局图
- 给定一个 pd_code 检查他是否是合法的（强合法性）
- 给定两个链环的 pd_code，求他们的连通和的 pd_code
- 生成所有可能的 composite 链环的序列化表示（使用小于等于 10 crossing 的素扭结与链环）
- 给定一个 pd_code （link 或者 knot）删除所有 nugatory crossing
- 给定一个 pd_code (link 或者 knot) 删除所有能用 r1-move 删除的 crossing
- 给定一个 pd_code，对某个特定的连通分支进行定向翻转
- 给定一个扭结或者链环，给出其 pd_code，计算其镜像扭结
- （需要 JRE）给定一个扭结或者链环的 PD_CODE，借助 JavaKh 计算 khovanov 同调
- 给定一个链环，为该链环的所有可能定向计算 khovanov 同调
请注意，这些列表中并没有依据 writhe 的正负性对标准 PD_CODE 进行镜像修正。这一修正在 hybrid_indexer 中得到实现。
- 常见扭结（含非素）的 PD_CODE
- 小于等于 11 crossing 的素 Link 的 PD_CODE 列表
- 常见标准 PD_CODE 的 writhe 列表：
- 常见扭结（含非素）的镜像 HOMFLY-PT 多项式
- 常见扭结（含非素）的 khovanov 同调
- 常见扭结（含非素）的 volume 列表
- 常见的 non-hyperbolic 素扭结名称序列
- khovanov 同调、HOMFLY-PT 多项式以及扭结补空间体积各自对小于等于 11 crossing 扭结的区分能力的比较报告
由于拆分拆得比较细，这里列举几个值得一看的项目：
- (网页端) 扭结连通分支计算器：
- (需要 JDK) 基于 khovanov 同调以及 HOMFLYPT 多项式，输入分子信息文件，推测扭结名
- (需要 JDK) 基于 khovanov 同调，输入 PD_CODE，推测扭结名
- (需要 JDK) 基于 khovanov 同调，输入分子信息文件，推测扭结名
- (需要 sage) 基于 HOMFLY-PT 多项式，输入 PD_CODE，推测扭结名
- (需要 snappy) 基于 non hyperbolic-knot 的补空间体积，输入 PD_CODE，推测扭结名
- (纯 C++) 输入扭结或者链环 PD_CODE，输出三维空间表示或者二维布局图
- (纯 Python) 对非素扭结或者非素链环进行表示，给出一种序列化的表示方式